Največje tveganje za živilsko industrijo predstavlja kontaminacija hrane. Preprečevanje morebitne mikrobne in navzkrižne kontaminacije je bistvenega pomena, da se izognemo plačilu hudih gospodarskih sankcij s katerimi se soočajo tisti, ki ne spoštujejo pravil GMP (Good Manufacturing Practice) ali ne uporabljajo protokola HACCP pri vzpostavljanju proizvodnih procesov.